Het denken in beelden vormt een belangrijk onderdeel van het onderwijs van de HvNA. Deze vorming van nauwkeuring waargenomen verschijnselen is o.a. onderdeel van therapeutische vorming en wordt in deze lessen aangeleerd en rationeel onderbouwd.

De HvNA brengt zowel het leren denken in beelden als in begrippen in haar onderwijs bij elkaar. Begrippen hebben vooral de functie om studenten te sensibiliseren op verfijnde waarnemingen. Naast feitelijke kennis (begripsdenken) staat de bewuste afstemming op hetgeen waargenomen en vertaald wordt in symptoombeelden (beelddenken), centraal. Het leren werken met beelden voert de student binnen in het holistisch karakter van de natuurgeneeswijzen. Het diagram is een middel (matrix) om systematisch en methodisch het beeld inzichtelijk te maken en te kunnen beargumenteren en onderbouwen.

Behalve bij therapeutische vorming wordt beeld- en begripsdenken ook bij de methodiekvakken gebruikt. Hierbij wordt naast de pure kennis die de student dient te bezitten, vooral de nadruk gelegd op de toepasbaarheid van die kennis in de praktijk. De HvNA is primair een beroepsopleiding.

Om als natuurgeneeskundig of klassiek homeopatisch therapeut de juiste diagnose te kunnen stellen, moet hij zich een levensecht beeld kunnen vormen van de problematiek van de persoon die hij tegenover zich heeft. Deze andere manier van kijken naar en omgaan met de patiënt vraagt een andere manier van onderwijs dan tot nu toe gebruikelijk is: de fenomenologische methode. De fenomenologische methode, vormt een belangrijk onderdeel van het onderwijs van de HvNA. Er wordt gewerkt vanuit probleemgestuurd onderwijs, waarbij de ervaring van de student centraal staat, ook bij de overdracht van cognitieve vaardigheden. Van en met elkaar leren. In die zin ontstaat een participerende leerroute.